Амидаза (AMD)
Ензими:Те са макромолекулни биологични катализатори, повечето ензими са протеини
Амидаза:Катализира хидролизата на различни ендогенни и чужди алифатни и ароматни амиди чрез прехвърляне на ацилова група към вода с производството на свободни киселини и амоняк.Хидроксамовата киселина и други органични киселини се използват широко като лекарства, тъй като те са съставни части на растежни фактори, антибиотици и туморни инхибитори.Амидазите могат да бъдат разделени на R тип и S тип ацилази според стереоселективността на катализатора.
В допълнение към катализирането на хидролизата на амидите, амидазата може също така да катализира реакции на ацилов трансфер в присъствието на ко-субстрати като хидроксиламин.
Амидазите с различни източници имат различна субстратна специфичност, някои от тях могат да хидролизират само ароматни амиди, някои от тях могат да хидролизират само алифатни амиди, а някои хидролизират α- или ω-аминоамиди.Повечето от амините имат добра каталитична активност само за ациклични или прости ароматни амиди, но за сложни ароматни съединения, хетероцикличните амиди, особено амидите с орто заместители, обикновено са с ниска активност (само няколко ензима проявяват по-добри каталитични ефекти).
Каталитичен механизъм:
Ензими | Код на продукта | Код на продукта |
Ензимен прах | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | комплект от 19 амидази, 50 mg всяка 19 артикула * 50 mg / артикул или друго количество |
Комплект за скрининг (SynKit) | ES-AMD-1900 | набор от 19 амидази, 1 mg всяка 19 артикула * 1 mg / бр |
★ Висока специфичност на субстрата.
★ Силна хирална селективност.
★ Висока ефективност на преобразуване.
★ По-малко странични продукти.
★ Леки условия на реакция.
★ Екологично чист.
➢ Ензимният скрининг трябва да се извърши за специфични субстрати поради специфичността на субстрата и да се получи ензим, който катализира целевия субстрат с най-добър каталитичен ефект.
➢ Никога не контактувайте с екстремни условия като: висока температура, високо/ниско pH и органичен разтворител с висока концентрация.
➢ Обикновено реакционната система трябва да включва субстрат, буферен разтвор (оптималното pH на реакцията на ензима).Ко-субстрати като хидроксиламин трябва да присъстват в реакционната система за ацил трансфер.
➢ AMD трябва да се добавя последен в реакционната система с оптимално pH и температура на реакцията.
➢ Всички видове AMD имат различни оптимални условия на реакция, така че всеки от тях трябва да бъде допълнително проучен индивидуално.
Пример 1(1):
Хидролизна активност към различни амидни субстрати
Субстрат | Специфична дейност μmol мин-1mg-1 | Субстрат | Специфична дейност μmol мин-1mg-1 |
ацетамид | 3.8 | ο-OH бензамид | 1.4 |
Пропионамид | 3.9 | p-OH бензамид | 1.2 |
Лактамид | 12.8 | ο-NH2бензамид | 1.0 |
Бутирамид | 11.9 | p-NH2бензамид | 0,8 |
Изобутирамид | 26.2 | ο-Толуамид | 0,3 |
Пентанамид | 22.0 | p-Толуамид | 8.1 |
Хексанамид | 6.4 | Никотинамид | 1.7 |
Циклохексанамид | 19.5 | Изоникотинамид | 1.8 |
Акриламид | 10.2 | Пиколинамид | 2.1 |
Метакриламид | 3.5 | 3-Фенилпропионамид | 7.6 |
Пролинамид | 3.4 | Индол-3-ацетамид | 1.9 |
Бензамид | 6.8 |
Реакцията се провежда в 50 mM буферен разтвор на натриев фосфат, рН 7.5, при 70 ℃.
Амиди | Хидроксиламин | Хидразин |
ацетамид | 8.4 | 1.4 |
Пропионамид | 18.4 | 3.0 |
Изобутирамид | 25,0 | 22.7 |
Бензамид | 9.2 | 6.1 |
Реакцията се провежда в 50 mM буферен разтвор на натриев фосфат, рН 7.5, при 70 ℃.
Свързана концентрация на реагента: амиди, 100 mM (бензамид, 10 mM);хидроксиламин и хидразин, 400 тМ;ензим 0,9 μM.
Пример 2(2):
Пример 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Екстремофили, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR и др.Процесна биохимия, 2015, 50 (8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM и др.Bioorganic Chemistry, 2017, достъпен онлайн 7.